Génotyper des bovins allaitants pour accélérer le progrès génétique
Ingenomix
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00:00Solange Fourisson, vous êtes chef de service un Genomics.
00:03Exactement.
00:04Alors la génomique en allaitant, c'est quelque chose dont on ne parle pas assez souvent quand même.
00:08À quoi ça sert la génomique en allaitant ?
00:12Alors la génomique, c'est un outil d'aide à la sélection et c'est assez révolutionnaire.
00:18Ça permet de connaître le potentiel génétique des animaux quasiment dès leur naissance,
00:23dès qu'on les prélève et donc ça permet de gagner et de bien sélectionner ces animaux
00:29bien plus rapidement que ce qu'on pouvait faire avant où il fallait attendre que les
00:34reproducteurs aient des produits qui soient pesés, pointés, enfin dont on connaisse
00:39leur performance.
00:40Donc là, un Genomics fait de la génomique sur de la limousine.
00:43Oui.
00:44Quel test vous proposez ?
00:45Alors, un Genomics a commencé la recherche sur les tests sur la génomique il y a une
00:51dizaine d'années et on commercialise depuis 2011 un test qu'on appelle Evalim qui comprend
00:57une évaluation, une prédiction sur 12 caractères, donc des caractères morphologiques et surtout
01:03des qualités maternelles qui sont les plus longs à connaître et qui apportent aussi
01:09le gros intérêt de la génomique et ont également des index iboval compilés à de la génomique.
01:15Ça permet aussi d'en profiter pour faire la filiation des animaux et connaître les
01:20gènes d'intérêt type culard, sans corne ainsi que des anomalies génétiques comme
01:26le palais fendu.
01:27Alors si par exemple l'éleveur veut juste rechercher ses gènes d'intérêt, il passe
01:31également par la génomique ou pas ?
01:32Alors c'est le même type de puce, c'est des marqueurs de l'ADN, mais spécifiques,
01:38c'est des mutations, donc on va chercher uniquement l'information avec un test plus
01:43simple donc moins coûteux pour connaître le statut culard ou non de l'animal, le type
01:50de mutation et également pour le sang-corne s'il est homozygote ou hétérozygote, si
01:55jamais il transmettra ce gène d'intérêt à l'ensemble de sa production ou seulement
02:01à la moitié.
02:02Alors ça coûte combien des tests génomiques comme ça ?
02:06Alors un test complet avec l'intégralité des caractères, ça va aller selon les quantités
02:11commandées de 60€ à 89€ pour des femelles et pour un mâle, où l'intérêt est évident
02:19au vu de la production des animaux, ça va être de 160€ à 200€.
02:24D'accord.
02:25Et alors les éleveurs qui font appel à vous le font plutôt sur la voie mâle je suppose
02:29?
02:30Aujourd'hui ça s'est très bien développé sur la voie mâle, les trois quarts des tests
02:33qu'on fait sont sur la voie mâle et on débute, on lance le génotypage femelle pour
02:39alors les génisses de l'année essentiellement afin de choisir les génisses de renouvellement
02:44et donc d'avoir un choix vraiment pertinent sur la voie femelle parce que l'intérêt
02:51de la génomique on l'oublie mais c'est aussi la précision qu'on va avoir sur la voie femelle
02:56qui sera équivalente à la précision qu'on peut avoir sur la voie mâle parce qu'on ne
03:00s'occupe pas du nombre de descendants mais bien juste de l'ADN de l'animal qu'on compare
03:06à l'ADN de toute la population.
03:08Et alors comment ça se rentabilise les tests génomiques ?
03:12Comment ça se rentabilise ? Donc si on investit dans la bonne génétique on va gagner aussi
03:18bien en frais d'élevage par exemple si on a des veillages faciles, si on a besoin de
03:23veillages faciles on va gagner en frais vétérinaires, en nombre de veaux sevrés, en productivité
03:28globale de l'exploitation, on peut gagner aussi en nombre de jours d'entretien en moins
03:34si jamais on choisit plutôt ces génisses de renouvellement, sur de l'engraissement
03:40on peut choisir des potentiels de croissance plus importants donc des animaux qui vont
03:46en mangeant la même quantité d'aliments grossir plus vite et on va les garder moins
03:49longtemps donc chaque jour d'entretien c'est toujours quelques euros dans l'élevage donc
03:56multiplié par une centaine d'animaux par jour ça finit par faire des grosses différences
04:01à la fin de l'année.
04:02Donc l'investissement dans la génétique on ne peut pas le quantifier très précisément
04:07parce que chaque exploitation a son mode de production et sa façon d'organiser mais
04:11l'investissement en génétique il est évident qu'il finit par faire la différence sur les
04:16élevages.
04:17Alors au niveau de la fiabilité de ces tests ?
04:19Alors la fiabilité donc c'était aussi le fait que avant de pouvoir étendre le développement
04:27les éleveurs attendaient des preuves de la fiabilité et donc c'est vrai que maintenant
04:32nous a fait presque dix ans qu'on a débuté les tests, on peut vraiment aujourd'hui on
04:36a fait des études cette année donc on va commencer à communiquer dessus sur la précision
04:43de ce qu'on avait prédit il y a cinq ans et comment ces animaux ont produit et on voit
04:47que les scores génomiques sont aujourd'hui le meilleur prédicteur de la production à
04:50venir.
04:51D'accord.
04:52Voilà on pourrait regarder les index ou des choses comme ça aussi on regarde par exemple
04:59les index des parents, la moyenne des index des parents c'est en général les scores
05:04génomiques vont être 30% à deux fois plus précis selon les caractères notamment sur
05:10les qualités maternelles on va être bien plus précis avec les génomiques plus tôt
05:14et donc aujourd'hui c'est l'outil à utiliser sur des animaux jeunes.
05:19Encore faut-il le rentabiliser là-dessus il y a pas mal de débats en élevage est-ce
05:24que c'est rentable de génotyper des animaux ? Comment ça se rentabilise ? C'est du coup
05:28on va plus vite on avance plus vite en fait dans la génétique c'est ça ?
05:30Alors le gain va être sur l'amélioration du troupeau, l'amélioration de la productivité
05:35du troupeau et voilà donc sur plus de productivité, plus de viande vive vendue à la fin avec des
05:42animaux aussi qu'on va garder plus longtemps parce qu'on les aura bien choisis et surtout
05:48sécuriser parce que le choix du reproducteur notamment sur les mâles c'est très important
05:52ça peut avoir des conséquences c'est plus pas combien ça rapporte mais combien ça
05:56peut éviter de perdre aussi un mauvais reproducteur qui va avoir des conséquences pendant plusieurs
06:02années dans un élevage s'il a des gros défauts on va avoir produit 30 femelles voire plus et
06:09ensuite pour corriger ça on va mettre plusieurs années donc c'est l'avenir quand même de
06:14l'élevage de bien choisir ses reproducteurs. Et alors on peut génotyper à partir de quel âge ?
06:18Alors pour les femelles dès la naissance et pour les mâles dans la race limousine
06:23on rend les scores à partir de neuf mois. Il y a une petite primauté pour le programme de
06:28sélection pour qu'ils puissent choisir l'intégralité des animaux parce que la génomique est aussi
06:33utilisée dans le programme de sélection à limousin c'est très important en amont de notamment de la
06:38sélection à l'anneau de la sélection des animaux qui vont aller au CI, au contrôle individuel pour
06:43l'insémination donc c'est un des outils parmi d'autres mais qui est très utilisé dans le
06:50programme de sélection. Et vous avez combien d'éleveurs qui utilisent la génomique actuellement ?
06:54La génomique est utilisée donc partout en France, il y a à peu près 800 cheptels aujourd'hui qui
07:01nous font confiance et on en vend aussi dans toute l'Europe, on a des distributeurs en Allemagne,
07:06en Suisse, en Hongrie... C'est quelque chose qui tend à se développer quand même. Voilà qui est
07:13très demandé et qui permet aussi aux animaux étrangers de se comparer à la génétique française
07:17qui est quand même le berceau de la race limousine. Vous avez une assez grande référence ?
07:22L'atout avec la race limousine et ce qui a fiabilisé les tests c'est qu'on a une très grande population de
07:25référence, on a génotypé depuis 2011 plus de 19 000 animaux et donc utilisables en population de
07:33référence qui ont des performances, aujourd'hui on en a à peu près 15 000. Ce qui est déjà pas mal.
07:36Ce qui permet de fiabiliser la prédiction. On représente bien la diversité de la race
07:43parce que sur les races allaitantes il y a encore plus de diversité génétique que sur les races
07:48laitières et c'est ce qui peut rendre sceptiques les éleveurs allaitants à la base sur le
07:52génotypage. Effectivement pour que ça fonctionne il faut bien connaître l'ensemble de la diversité
07:57génétique de la race. Tout ce que vous êtes en train de faire. Merci pour ces infos. Merci à vous.