Simulation du domaine SH2 et d'un ligand (GPUGrid)

  • il y a 15 ans
Dynamique moléculaire guidée.
Extirpation à 5 ångström par nanoseconde sur 15 nanosecondes
Environ 40.000 atomes (les atomes d'eau ne sont pas représentés pour simplifier la représentation).
Simulation obtenue en faisant tourner le programme ACEMD sur des cartes graphiques Nvidia GTX 280
ACEMD est un programme qui permet d'obtenir des simulations de dynamique moléculaire grâce aux cartes graphiques.
Cette approche utilise les codes de Dynamique Moléculaire (MD) tels que Charmm et Amber bien connus des spécialistes de biologie structurale.

Plus d'information :
http://www.boinc-af.org/content/view/622/219/
http://www.dailymotion.com/user/BOINC-AF/video/x9mw0h_simulation-du-domaine-sh2-et-dun-ph_tech

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